貝瑞基因

6月30日下午，貝瑞基因（000710.SZ）向外界公布了三代測序儀科研的最新進(jìn)展：由公司參與完成的三代SMA（脊髓性肌萎縮癥）臨床回顧性研究成果，近期發(fā)表于分子診斷領(lǐng)域權(quán)威國際學(xué)術(shù)期刊 Journal of Molecular Diagnostics（即時IF=5.568）。此次研究證明，公司三代SMA相比qPCR、MLPA等傳統(tǒng)檢測方法，覆蓋更全面，檢測更精準(zhǔn)。

就三代SMA的市場前景等，貝瑞基因董事長高揚(yáng)接受鈦媒體采訪時表示：“可以看到SMA、CAH、地貧、FXS的單病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)并不高，但是在生育過程中，夫妻雙方單個人攜帶的風(fēng)險(xiǎn)其實(shí)是很高的，所以這也是為什么攜帶者篩查的市場需求較大（的原因）。”

【資料圖】

擴(kuò)展性攜帶者篩查未來存在較大的市場空間。貝瑞基因市場總監(jiān)趙智賢分析認(rèn)為，2021年我國結(jié)婚登記人數(shù)763.6萬對，擴(kuò)展性攜帶者篩查平均市場單價(jià)按2000元／例計(jì)算，理論篩查比例按照產(chǎn)業(yè)篩查率達(dá)到65%推算，2021年理論擴(kuò)展性攜帶者篩查市場容量預(yù)計(jì)高達(dá)198.5億元。

SMA口服藥堪稱“天價(jià)”，攜帶者篩查尤為必要

據(jù)了解，此次三代SMA研究成果由中國福利會國際和平婦幼保健院與貝瑞基因聯(lián)合發(fā)表，中國福利會國際和平婦幼保健院王彥林教授和貝瑞基因毛愛平博士為這項(xiàng)研究的通訊作者。

公開資料顯示，SMA即脊髓性肌萎縮癥（Spinal Muscular Atrophy），是一類由脊髓前角運(yùn)動神經(jīng)元變性導(dǎo)致肌無力和肌萎縮的遺傳性肌肉疾病。SMA為嬰幼兒中第二常見的致死性常染色體隱性遺傳病，人群攜帶率為1/72-1/47，發(fā)病率為1/10000-1/6000。

雖攜帶率不算高，但一旦患上此病，只能修正治療不能根治，且昂貴的治療費(fèi)用讓諸多家庭望而卻步。據(jù)山東省藥械集中采購平臺近日公告，SMA口服藥利司撲蘭主動申請降價(jià)，調(diào)整后價(jià)格為每瓶1.45萬元。按年齡體重計(jì)算，價(jià)格調(diào)整后最大使用劑量患者年治療費(fèi)用將低于45萬元。

顯然，SMA攜帶者篩查才是降低該病種發(fā)病率的良方。據(jù)貝瑞基因三代事業(yè)部總監(jiān)任志林介紹， SMA攜帶者分三種情況：91-94%的攜帶者只有一個正常功能的SMN1拷貝（1+0），2-5%的攜帶者含有兩個SMN1拷貝，但其中一個包含致病點(diǎn)突變（1+1D），另外4%為沉默型攜帶者，即有兩個SMN1拷貝，但都位于同一條染色體上（2+0）。目前qPCR、MLPA等傳統(tǒng)基因檢測方法無法檢測1+1D和2+0攜帶者，殘余風(fēng)險(xiǎn)最高可達(dá)1/415（1/1245-1/415）。

而三代測序具有超長讀長、無GC偏好、對高度重復(fù)等復(fù)雜區(qū)域也能夠準(zhǔn)確測序等技術(shù)優(yōu)勢，且技術(shù)成本持續(xù)下降，2025年將實(shí)現(xiàn)與二代測序成本持平。在此基礎(chǔ)上，貝瑞基因開發(fā)出三代SMA基因全面檢測技術(shù)，全球首次實(shí)現(xiàn)SMN1及SMN2基因近30kb全長序列的高效率三代HIFI測序。CASMA還能同時檢測SMN1及SMN2基因拷貝數(shù)、全基因范圍內(nèi)致病性SNVs及Indels，并主動提示沉默型“2+0”的攜帶風(fēng)險(xiǎn)。

此次三代SMA回顧性臨床研究顯示，CASMA一次性精準(zhǔn)檢測所有337例樣本的SMN1及SMN2基因拷貝數(shù)，對SMN1拷貝數(shù)缺失的檢測靈敏度高達(dá)100%。CASMA還成功檢測出4例會被qPCR、MLPA等傳統(tǒng)方法漏檢的SMN1基因點(diǎn)突變攜帶者（1+1D）。通過專利分析方法，CASMA直接預(yù)測出全部7例（來自4個家系）已知“2+0”型攜帶者。數(shù)據(jù)顯示，CASMA能大大改善SMA患者基因診斷及預(yù)后判斷，提高SMA新生兒基因篩查效率，將攜帶者檢出率從91-94%提高到98%以上，將殘余風(fēng)險(xiǎn)降低4-5倍。

下一站場景，一鍵解決單基因全病種檢測

事實(shí)上，三代SMA只是貝瑞基因三代測序臨床轉(zhuǎn)化體系中的一塊拼圖。不久前，由貝瑞基因提供技術(shù)支持的三代CAH（先天性腎上腺皮質(zhì)增生癥）臨床回顧性研究成果，發(fā)表于檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域權(quán)威國際學(xué)術(shù)期刊Clinical Chemistry（即時IF=11.784）。更早一些，2021年上半年，公司發(fā)起了地中海貧血基因圖譜（TiGA）計(jì)劃。2021年7月，由貝瑞基因提供技術(shù)支持的三代地貧多中心臨床前瞻性研究成果在The Journal of Molecular Diagnostics 上發(fā)表。

此外，貝瑞基因還有21臺 PacBio Sequel II/IIe 三代測序儀儲備，目前公司已將三代測序技術(shù)觸達(dá)多種罕見病，包括三代地貧、三代CAH、三代SMA等產(chǎn)品相繼落地。其中，三代地貧檢測試劑盒近期取得醫(yī)療器械注冊倫理批件，進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段。三代CAH和三代SMA技術(shù)則在2022年取得發(fā)明專利證書。

貝瑞基因三代事業(yè)部總監(jiān)任志林接受鈦媒體采訪時表示：“把三代測序技術(shù)用在生殖健康領(lǐng)域、以及出生缺陷防控領(lǐng)域，在我們這樣一個人口基數(shù)非常龐大的國家是很有價(jià)值的，有臨床的實(shí)用性和前瞻性，而且我們也能想到這些遺傳病不只是中國人的問題，實(shí)際上是全球的問題?！?/p>

對于三代測序的下一站應(yīng)用場景，“一鍵解決”單基因全病種檢測是貝瑞基因的目標(biāo)。貝瑞基因介紹，因?yàn)楣镜母鞣N產(chǎn)品是高度兼容，所以更容易實(shí)現(xiàn)一次性解決多種疾病，而從一到多，準(zhǔn)確性不會受到影響。（首發(fā)鈦媒體，作者|張海霞，編輯|崔文官）

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