
8日從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院獲悉,該院北京畜牧獸醫(yī)研究所動物基因工程與種質(zhì)創(chuàng)新科技創(chuàng)新團隊聯(lián)合北京相關(guān)生物企業(yè)等單位,成功繪制了梅山豬高質(zhì)量基因組圖譜。該圖譜是迄今為止精度最高的亞洲豬基因組圖譜,為我國地方豬種質(zhì)資源保護和開發(fā)利用奠定了基礎(chǔ)。相關(guān)成果近日發(fā)表于國際期刊《分子生態(tài)資源》。
據(jù)項目負責(zé)人周榮博士介紹,我國地方豬種具有肉質(zhì)好、抗逆性強、耐粗飼等特點,是生豬種業(yè)持續(xù)創(chuàng)新和實現(xiàn)種源自主可控的良好素材。此前,國內(nèi)外學(xué)者針對我國地方豬種的抗病力、繁殖性能等重要經(jīng)濟性狀的遺傳機制開展了大量研究,產(chǎn)生了海量重測序、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),但分析這些數(shù)據(jù)需要與參考基因組進行比對,亞洲家豬的參考基因組圖譜卻一直沒有被測明繪制。
研究人員此次成功繪制了我國地方品種梅山豬的高質(zhì)量基因組圖譜,共注釋到22074個編碼基因,是目前完整度最高、連續(xù)性最強的亞洲豬基因組圖譜。研究人員對梅山豬和西方主要的參考豬種——杜洛克豬的基因組進行了比較分析,發(fā)現(xiàn)梅山豬基因組與其共存在49103個結(jié)構(gòu)變異,其中4.02%是亞洲豬特有的結(jié)構(gòu)變異。研究還發(fā)現(xiàn)亞洲豬X染色體上存在一個特有結(jié)構(gòu)變異熱點,該熱點富集了與亞洲豬脂肪沉積、高繁殖力等特異性表型相關(guān)的基因,這一發(fā)現(xiàn)將有助于未來豬的新品種培育改良。
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